Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms