Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF7Q9UBF6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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