Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms