Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms