Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms