Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG3Q9NT62 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms