Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms