Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms