Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms