Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPCPD1Q9NPB8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms