Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPJQ9HC77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPJQ9HC77 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms