Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms