Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFAF3Q9BU61 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms