Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THUMPD2Q9BTF0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms