Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERPUD2Q9BSE4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERPUD2Q9BSE4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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