Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms