Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LARP6Q9BRS8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LARP6Q9BRS8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms