Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM7Q9BQ49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms