Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms