Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF5Q99942 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF5Q99942 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF5Q99942 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF5Q99942 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF5Q99942 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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