Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms