Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCT8L2Q96SF2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCT8L2Q96SF2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms