Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUDCD1Q96RS6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms