Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms