Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEURL4Q96JN8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms