Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG3Q96JB2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms