Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LTV1Q96GA3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTV1Q96GA3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms