Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BICD1Q96G01 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BICD1Q96G01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms