Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms