Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms