Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMTM5Q96DZ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CMTM5Q96DZ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMTM5Q96DZ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms