Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM52Q96A61 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM52Q96A61 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms