Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC47Q96A33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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