Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKL1Q969V6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKL1Q969V6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms