Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms