Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms