Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP133Q8WUM0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms