Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC12Q8WUD4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms