Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGDCC4Q8TDY8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms