Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms