Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC148Q8NFR7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms