Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms