Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDCL2Q8N4E4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCL2Q8N4E4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms