Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms