Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSIG10Q8N0Z9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG10Q8N0Z9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms