Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKAP1Q86WV1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms