Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CATSPER4Q7RTX7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms