Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms