Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C15orf39Q6ZRI6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C15orf39Q6ZRI6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms