Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SUSD1Q6UWL2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SUSD1Q6UWL2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms